Schwingungsverhältnisse innerhalb der ersten 16 Partialtöne sind grün gekennzeichnet.
Abkürzungen:
HT = Halbton (Abstand 15.-16. Partialton), kGT = kleiner Ganzton (Abstand 9.-10. Partialton), gGT = großer Ganzton (Abstand 8.-9. Partialton), Okt = Oktave, pythag. = pythagoräisch
Begriffsentsprechungen:
syntonisches Komma = didymisches Komma und enharmonisches Komma = Kleine Diësis

Außerhalb von HT / kGT / gGT - Kombinationen, aber vom Centwert her nahe bei dem gleichstufigen Äquivalent sind folgende Intervalle, die sich aus der Partialtonreihe ableiten lassen:

Weitere Intervalle sind in den Intervall-Listen der Huygens-Fokker Foundation und auf www.kilchb.de zu finden.

Anhand der Partialtonreihe werden die Intervall-Verhältnisse deutlich:

Teilt man die Ordinalzahlen zweier Partialtöne, so erhält man das Schwingungsverhältnis des entsprechenden Intervalls. Nehmen wir als Beispiel die große Sexte, die in der Partialtonreihe vom 5. zum 3. Ton zu finden ist, so können wir daran ablesen, dass die beiden Töne der großen Sexte im Verhältnis 5 : 3 schwingen.
Weiterhin kann man die Probleme ablesen, die bei Molldreiklängen entstehen: Die oben erwähnte «Mollterz» erzeugt Dissonanzen im Dreiklang. In der Partialtonreihe sind das die Partialtöne 16-19-24 für c-es-g. Der Differenzton zwischen c und es ist 19-16 = 3 ein G und zwischen 24-19 = 5 ein e. Es entsteht also der bitonale Akkord G-e-c''-es''-g''. Einen andereren Molldreiklang in der Partialtonreihe haben wir bei den Partialtönen 10-12-15 mit e-g-h. Die Differenztöne sind demnach: 12-10 = 2 ein c und 15-12 = 3 ein g. Damit klingt dieser Akkord c-g-e''-g''-h'' wie ein Großer Durseptakkord (Major-7). Schlussakkorde von Mollstücken lassen sich also nur mit einem Durakkord rein konsonant intonieren.

Die reinen Intervalle, wie sie aus der Partialtonreihe ableitbar sind, ergeben kein melodisch und harmonisch in sich geschlossenes Tonsystem. Die Abweichungen werden mit den drei wichtigsten Kommata deutlich.

Ein weitres Phänomen ist gut aus der Partialtonreihe ableitbar: die Haupt-Kombinationstöne (Differenztöne) errechnen sich aus der Differenz der entsprechenden Ordinalzahlen der Partialtonreihe.